As doenças infetocontagiosas são aquelas que podem ser transmitidas por bactérias, vírus, fungos, parasitas e outros microrganismos. São doenças que podem ser transmitidas por vetores, ou diretamente de animal para animal e até do animal para os humanos (Zoonoses).
Infelizmente algumas destas doenças podem requerer a hospitalização do animal e por isso o Hospital conta com um internamento próprio e isolado para hospitalizar animais com doenças infetocontagiosas. Deste modo, conseguimos controlar a doença e proteger os restantes animais hospitalizados, assim como todos aqueles envolvidos no seu tratamento caso a doença seja transmissível ao Homem.